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Atividade

134027 - CURSO: Ciências Ômicas em Doenças Infecciosas (Sede: IQ ou FFLCH - Campus Butantã)

Período da turma:

14/07/2025 a 16/07/2025

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Descrição:

Este curso proporcionará um ambiente multidisciplinar para aprender os princípios teóricos e
aplicá-los nas sessões práticas. As aulas teóricas serão dadas a fim de introduzir o tema e mostrar os últimos desenvolvimentos no campo. As sessões práticas se concentrarão na aplicação a diferentes sistemas biológicos de diferentes análises. Palestras de vários pesquisadores que trabalham com doenças infecciosas e ciências ômicas. Além disso, cada aluno visitará as instalações e empresas essenciais para processar suas amostras para seus próprios projetos. Cada professor é altamente qualificado para dar este curso oferecendo seu conhecimento a cada aluno. Devido a isso, um grande fórum para discutir os desenvolvimentos das mais recentes das ciências ômicas e como é possível aplicá-las a cada projeto. No final do curso cada aluno será capaz de:
Ler criticamente um artigo envolvendo ciências ômicas;
Compreender os princípios e metodologias das ciências ômicas;
Reproduzir uma experiência envolvendo ciências ômicas;
Pesquisar em bases de dados públicos disponíveis os experimentos em larga escala realizados por outros investigadores;
Compartilhar informações das instalações e empresas existentes no mercado para outros pesquisadores; compartilhando novas ideias e abordagens esperamos gerar novas pesquisas
colaborativas, e o cronograma será projetado para permitir tempo de sobra para as interações
além das palestras.

1.1. Introdução ao curso
2. Genômica
2.1. O que é genômica e por que precisamos da genômica?
2.2. Explicação dos princípios genômicos;
2.3. Abordagens experimentais à genômica;
2.4. Algoritmos;
2.5. Manipulação de dados de genômica com as plataformas livremente disponíveis e de código livre;
2.6. Palestras de pesquisadores que trabalham com doenças infecciosas e genômica;
2.7. Software online e de linha de comando e bases de dados genômicas disponíveis (parte
prática);
3. Transcriptômica
3.1. O que é transcriptômica e por que precisamos transcriptômica?
3.2. Explicação dos princípios transcriptômicos;
3.3. Sequência antiga e de próxima geração;
3.4. Algoritmos;
3.5. Manipulação de dados de transcriptômica com plataformas livres disponíveis e de código livre;
3.6. Palestras de pesquisadores que trabalham com doenças infecciosas e transcriptômicas;
3.7. Ferramentas e bases de dados bioinformáticas disponíveis para análise de dados
transcriptómicos (parte prática);
4. Proteômica
4.1. Espectrometria de massa: princípios e instrumentação;
4.2. O que é proteômica e por que precisamos da proteômica?
4.3. Explicação dos princípios proteómicos da preparação da amostra à análise;
4.4. Proteômica quantitativa e PTMs;
4.5. Software para análise de proteínas;
4.6. Palestras de pesquisadores que trabalham com doenças infecciosas e proteômica;
4.7. Extracção de proteínas, digestão e dessalinização (parte prática);
4.8. Pesquisa na base de dados (parte prática);
5. Lipidômica/Metabolomica

5.1. O que é lipidômica e por que precisamos lipidômica?
5.2. Explicação de experimentos de lipidômica;
5.3. Preparação de amostras e análise de um extrato lipídico;
5.4. Software e bases de dados;
5.5. Palestras de pesquisadores que trabalham com doenças infecciosas e
lipidômica/metabolômica;
5.6. Extração de lipídeos de uma fonte biológica e análise de espectrometria de massa (parte
prática);
5.7. Análise de dados (parte prática).

1. Baumann S, Kalkhof S, Hackermuller J, Otto W, Melanie Tomm J, Klaus Wissenbach D, et al.
Requirements and perspectives for integrating metabolomics with other omics data. Curr
Metabolomics. 2012;1(1):15–27.
2. Ren S, Shao Y, Zhao X, Hong CS, Wang F, Xin L, Jia L, Guozhu Y, Min Y, Zhengping Z, Chuanliang X, Guowang X, Yinghao S. Integration of Metabolomics and Transcriptomics Reveals Major Metabolic Pathways and Potential Biomarker Involved in Prostate Cancer. Mol Cell Proteomics. 2016;15(1):154–63. doi: 10.1074/mcp.M115.052381.
3. Integrated omics analysis of pathogenic host responses during pandemic H1N1 influenza virus infection: the crucial role of lipid metabolism. Cell Host Microbe. 2016 Feb 10; 19(2): 254–266.
4. Proteomics and integrative omic approaches for understanding host–pathogen interactions and infectious diseases. Mol Syst Biol. 2017 Mar; 13(3): 922.
5. An integrated stewardship model: antimicrobial, infection prevention and diagnostic (AID). Future Microbiology January 2016 ,Vol. 11, No. 1, Pages 93-102 , DOI 10.2217/fmb.15.99
6. A Systems Biology Approach to Infectious Disease Research: Innovating the Pathogen-Host Research Paradigm. doi: 10.1128/mBio.00325-10. February 2011 mBio vol. 2 no. 1 e00325-10 7. A time-resolved molecular map of the macrophage response to VSV infection. npj Systems Biology and Applications 2, Article number: 16027 (2016) oi:10.1038/npjsba.2016.27
8. A multifaceted ‘omics’ approach for addressing the challenge of antimicrobial resistance. Future Microbiol. (2015) 10(3), 365–376
9. Baumann S, Kalkhof S, Hackermuller J, Otto W, Melanie Tomm J, Klaus Wissenbach D, et al. Requirements and perspectives for integrating metabolomics with other omics data. Curr Metabolomics. 2012;1(1):15–27.
10. Ren S, Shao Y, Zhao X, Hong CS, Wang F, Xin L, Jia L, Guozhu Y, Min Y, Zhengping Z, Chuanliang X, Guowang X, Yinghao S. Integration of Metabolomics and Transcriptomics Reveals Major Metabolic Pathways and Potential Biomarker Involved in Prostate Cancer. Mol Cell Proteomics. 2016;15(1):154–63. doi: 10.1074/mcp.M115.052381.
11. Integrated omics analysis of pathogenic host responses during pandemic H1N1 influenza virus infection: the crucial role of lipid metabolism. Cell Host Microbe. 2016 Feb 10; 19(2): 254-266.
12. Proteomics and integrative omic approaches for understanding host–pathogen interactions and infectious diseases. Mol Syst Biol. 2017 Mar; 13(3): 922.
13. An integrated stewardship model: antimicrobial, infection prevention and diagnostic (AID). Future Microbiology January 2016 ,Vol. 11, No. 1, Pages 93-102 , DOI 10.2217/fmb.15.99
14. A Systems Biology Approach to Infectious Disease Research: Innovating the Pathogen-Host Research Paradigm. doi: 10.1128/mBio.00325-10. February 2011 mBio vol. 2 no. 1 e00325-10
15. A time-resolved molecular map of the macrophage response to VSV infection. npj Systems Biology and Applications 2, Article number: 16027 (2016) doi:10.1038/npjsba.2016.27
16. A multifaceted ‘omics’ approach for addressing the challenge of antimicrobial resistance. Future Microbiol. (2015) 10(3), 365–376

Carga Horária:

30 horas

Tipo:

Optativa

Vagas oferecidas:

Ministrantes:

Giuseppe Palmisano

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