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Atividade

126429 - Curso de Verão em Bioinformática - USP | 2025

Período da turma:

17/02/2025 a 21/02/2025

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Descrição:

A semana será composta por palestras teóricas ministradas por 22 palestrantes convidados (orientadores do
Programa Inter unidades de Pós-Graduação em Bioinformática, professores USP de outros departamentos e
especialistas), oferecendo uma introdução panorâmica aos seus diferentes temas de estudo. Além disso, as
palestras proporcionarão aos alunos exemplos de situações e diversos problemas-alvo que a bioinformática
lida no dia a dia, bem como as soluções computacionais envolvidas. Os alunos do curso terão a oportunidade
de interagir com os pesquisadores e conhecer algumas das linhas de pesquisa. Em particular, esperamos que
essa semana proporcione uma preparação básica aos potenciais candidatos aos programas de mestrado e
doutorado.
Detalhamento das atividades científicas:
- Cursos de nivelamento: uma vez que o Curso de Verão em Bioinformática é caracterizado por um público alvo
heterogêneo e não demanda um conhecimento prévio para sua realização, cursos de nivelamento em
Biologia Molecular e Computação são oferecidos no primeiro dia do evento. Esses cursos são proferidos por
profissionais altamente qualificados sendo destinados à promoção do conhecimento básico em ambas as áreas
de modo a preparar participantes para um melhor aproveitamento nas palestras expositivas e técnicocientíficas.
- Palestras expositivas: palestras proferidas por docentes e egressos do Programa Inter unidades de Pós-
Graduação em Bioinformática da USP, bem como por convidados externos ao programa. Tais palestras são
destinadas à socialização e à difusão de conhecimento e conceitos básicos sobre Bioinformática.
- Cursos práticos: os cursos práticos geralmente são proferidos por discentes do Programa Inter unidades de
Pós-Graduação em Bioinformática - USP ou por especialistas dessa área de modo a apresentar seus conceitos
fundamentais, as principais linguagens de programação, boas práticas de programação, bem como programas
de análise. Esses cursos práticos podem ser compostos de aula expositiva e prática ou somente prática (no
próprio auditório do curso).
Descrição das atividades:
1º dia – Nivelamento (introdução à biologia molecular; introdução à computação; introdução à bioinformática)
e curso prático;
2º dia – Transcriptômica, proteômica, metabolômica, epigenômica e primeira parte do curso de bash básico.
3º dia – Genômica, metagenômica, filogenômica, alinhamento de sequências e segunda parte do curso de bash
básico.
4º dia – Evolução genômica, biologia estrutural, sequenciamento de RNA de célula-única e aprendizado de
máquina.
5º dia – Estatística para bioinformática, biologia de sistemas, ciência de redes e organização de pipelines.
BIBLIOGRAFIA:
- Bioinformatics. Baxevanis and Ouellette (Eds.) Wiley-Interscience, 2005 (3a edição)
- D. Mount. Bioinformatics. CSHL Press, 2004 (2a edição)
- T. A. Brown. Genomes 4. Garland Science; 4th edition, 2017 (3a edição)
- A. Mushegian. Foundations of comparative genomics. Academic Press, 2007.
- Cristianini and Hahn. Introduction to computational genomics. Cambridge University Press, 2006.

Carga Horária:

30 horas

Tipo:

Optativa

Vagas oferecidas:

100

Ministrantes:

Alan Mitchell Durham
Denise Aparecida Botter
Eduardo Moraes Rego Reis
Fernando Luis Barroso da Silva
Gabriela Felix Persinoti
Gianluca Major Machado da Silva
Helder Takashi Imoto Nakaya
João Marcelo Pereira Alves
Marielton dos Passos Cunha
Michel Satya Naslavsky
Patrícia Pereira Duzi Carvalho
Pedro Alexandre Favoretto Galante
Pedro Henrique Souza de Medeiros
Rayana dos Santos Feltrin
Renato Tinós
Ronaldo Fumio Hashimoto
Taran Grant
Tathiane Maistro Malta Pereira
Tiago Antonio de Souza

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