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Atividade
| 126205 - Coleta, manejo e síntese de dados de biodiversidade |
| Período da turma: | 30/09/2024 a 31/07/2025
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| Descrição: | Dentre os aulas e atividades ligadas às práticas, serão abordados os seguintes tópicos:
- Definição de dados em biodiversidade: primários e secundários - Principais fontes e tipos de dados em biodiversidade - Métodos e ferramentas de coletas de dados - Prática de coletas de dados - Manejo de dados de biodiversidade: ocorrência de espécies - Manejo de dados de biodiversidade: medidas de indivíduos - Manejo de dados de biodiversidade: validação taxonômica - Manejo de dados de biodiversidade: validação de metadados (e.g. coordenadas) - Manejo de dados de biodiversidade: rastreabilidade e reprodutibilidade - Análise de dados: resumos e métricas de diversidade, descritores de espécies e comunidades e técnicas de visualização dos dados em linguagem R - Análise de dados: síntese e noções sobre lacunas de conhecimento Referências • Besnard, G., Gaudeul, M., Lavergne, S., Muller, S., Rouhan, G., Sukhorukov, A. P., van der Poorten, A. & Jabbour, F. 2018. Herbarium-based science in the twenty-first century. Botany Letters 165: 323–327. • Braun-Blanquet, J. 1932. Plant sociology. New York: McGraw Hill. 439p. • Carvalho, G. 2020. flora: Tools for Interacting with the Brazilian Flora 2020. R package version 0.3.4. • Cain, S.A., Castro, G.M.O., Pires, J.M.; Silva, N.T. 1956. Application of some phytossociological techniques to Brazilian rain forest. American Journal of Botany, 43(10): 911-941. • Colwell, R.K.; Coddington, J.A. 1994. Estimating terrestrial biodiversity through extrapolation. Philosophical Transactions of the Royal Society of London (B) 345(1131): 101-118. • Cottan, G. ; Curtis, J.T. 1956. The use of distance measures in phytossociological sampling. Ecology 37(4): 451-460. • Foo, Y.Z., O’Dea, R.E., Koricheva, J., Nakagawa, S., Lagisz, M., 2021. A practical guide to question formation, systematic searching and study screening for literature reviews in ecology and evolution. Methods Ecol. Evol. 12, 1705–1720. • Goodall, D.W. 1970. Statistical plant ecology. Annual Review of Ecology and Systematics 1: 99-124. • Graham, C., Ferrier, S., Huettman, F., Moritz, C. and Peterson, A. 2004. New developments in museum-based informatics and applications in biodiversity analysis. Trends in Ecology Evolution 19: 497–503. • de Lima, R.A.F., Sánchez‐Tapia, A., Mortara, S.R., ter Steege, H. and de Siqueira, M.F., 2023. plantR: An R package and workflow for managing species records from biological collections. Methods in Ecology and Evolution 14(2): 332-339. • Liu, C., White, M. and Newell, G. (2018) Detecting outliers in species distribution data. Journal of Biogeography 45: 164–176. • Magurran, A.E. 2004. Measuring biological diversity. Oxford: Blackwell Publishing. 256p. • Mueller-Dombois, D.; Ellenberg, H. 1974. Aims and methods of vegetation analysis. New York: Wiley. 574p. • Peterson, A. T., Asase, A., Canhos, D., de Souza, S. and Wieczorek, J. 2018. Data Leakage and Loss in Biodiversity Informatics. Biodiversity Data Journal 6: e26826. • Pullin, A.S., Stewart, G.B., 2006. Guidelines for Systematic Review in Conservation and Environmental Management. Conserv. Biol. 20: 1647–1656. • R Core Team, 2020. R: A language and environment for statistical computing. R Found. Stat. Comput. Vienna, Austria. • Schilling, A.C.; Batista, J.L.F. Curva de acumulação de espécies e suficiência amostral em florestas tropicais. Revista Brasileira de Botânica 31(1): 179-187. • Sutherland, W.J. 2006. Ecological census techniques: a handbook. 2 ed. Cambridge: Cambridge University Press. 432p. • Sweeney, P. W., Starly, B., Morris, P. J., Xu, Y., Jones, A., Radhakrishnan, S., Grassa, C. J. and Davis, C. C. 2018. Large-scale digitization of herbarium specimens: Development and usage of an automated, high-throughput conveyor system. Taxon 67: 165–178. • Westgate, M.J., 2019. revtools: An R package to support article screening for evidence synthesis. Res. Synth. Methods 10: 606–614. • Willemse, L. P., Van Welzen, P. C. and Mols, J. B. 2008. Standardisation in data-entry across databases: Avoiding Babylonian confusion. Taxon, 57, 343–345. 625 |
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| Carga Horária: |
256 horas |
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| Tipo: | Obrigatória | ||||
| Vagas oferecidas: | 15 | ||||
| Ministrantes: |
Renato Augusto Ferreira de Lima |
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