Atividade

115165 - Avanços e perspectivas da Genética e da Genômica no mundo moderno.

Período da turma: 25/01/2024 a 02/02/2024

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Descrição: PALESTRAS:

1) Regulação gênicas em fungos – Profa. Dra. Nilce M. M. Rossi
Ementa: A regulação da expressão gênica serve principalmente para permitir que as células se ajustem às mudanças nutricionais e ambientais, de forma que o seu crescimento e divisão sejam otimizados. Em eucariotos a expressão gênica também controla um programa genético fundamental para o desenvolvimento embrionário e a diferenciação celular. Em fungos patogênicos esta regulação é fundamental para ativar mecanismos que favoreçam a interação com o hospedeiro e adaptação a este habitat, bem como para resistir a drogas antifúngicas que são utilizadas para controlar estas infecções. Entender estes mecanismos do ponto de vista molecular contribui para revelar novos alvos terapêuticos que possam ser utilizados para o desenvolvimento de novos fármacos.

2) Os genomas das abelhas eusocialis Meliponi: modelo para estudo de dominância reprodutiva – Profa. Dra. Zilá Luz Paulino Simões
Ementa: Os himenópteros constituem um grupo muito antigo e diversificado entre os insetos, inclui as abelhas, vespas e formigas, que se distribuem em todos os nichos existentes em nosso planeta. As abelhas representam uma força de trabalho responsável pela polinização e manutenção do equilíbrio de numerosos ecossistemas. Além disto, abelhas têm características únicas, que as tornam organismos ideais para estudos genômicos. Por exemplo, o sistema de determinação do sexo, a haplodiploidia, uma fina organização social, com a presença de uma rainha reprodutiva. Entre as abelhas, a própria organização social constitui um desafio, este grupo inclui grupos altamente sociais, abelhas operárias com diferente potencial reprodutivo e capacidade cognitiva surpreendente. As abelhas F. varia, se caracterizam por um comportamento reprodutivo particular, as rainhas detêm o monopólio da reprodução, não há, portanto, operárias poedeiras, mesmo na ausência da rainha; uma situação que tipicamente favorece a ativação dos ovários das operárias jovens, em outras espécies de abelhas. A completa dominância da rainha faz de F. varia uma espécie crítica para estudos de genômica comparativa e entendimento da evolução do sistema de determinação de castas, divisão do trabalho reprodutivo e eusocialidade.

3) Calibrando a Biomol - Prof. Dr. Francis de Morais Franco Nunes:
Ementa: Em 1953 entramos na era molecular. A estrutura tridimensional (dupla hélice) do DNA foi proposta no clássico trabalho de Watson e Crick, publicado na Nature. A partir de então uma série de descobertas foram conseqüências: duplicação semiconservativa do DNA (1958), RNA mensageiro (1961), definição do código genético (1966), contribuindo para o avanço acelerado da Genética e outros campos das Ciências.

4) Interação meio ambiente / genoma: lições de um organismo modelo não convencional - Prof. Dr. Klaus Hartmann Hartfelder
Ementa: O fenótipo de um organismo, e implicitamente a variabilidade fenotípica dentro de uma população, é resultado da interação de fatores do meio ambiente com o genoma de cada indivíduo. Tal relação é especialmente interessante no caso dos insetos sociais, nos quais um único genótipo tem o potencial de gerar fenótipos totalmente distintos, as castas rainha e operária, dependente da dieta que as larvas recebem. Discutiremos como vias de sinalização de sensoriamento do estado nutricional e o sistema endócrino regulam a expressão gênica durante o desenvolvimento pós-embrionário desses insetos e as suas consequências na diferenciação dos orgãos e sistemas, especialmente do sistema reprodutivo, e como afetam a longevidade dos adultos.

5) Evolução: processo geracional de mudanças genéticas – Profa. Dra. Maura Helena Manfrin
Ementa: Um estudo evolutivo pode ser dividido em duas grandes áreas: organização da diversidade, realizada por meio de análises filogenéticas, e o estudo das mudanças nas populações ao longo do tempo. Nesta palestra serão consideradas e discutidas o desenvolvimento das ideias sobre evolução no nível populacional e seus implicações para entendimento da diversidade biológica.

6) Mecanismos de resistência das abelhas contra doenças e pragas - Prof. Dr. David De Jong
Ementa: As abelhas Africanizadas no Brasil são bastante resistentes a muitas das pragas e doenças que provocam a perda das colmeias em grande parte do mundo. Investigamos os mecanismos envolvidos, incluindo como a nutrição afeta a manutenção e a expressão dos genes do sistema imune. Também estamos pesquisando como a seleção natural funciona para manter os mecanismos de resistência, permitindo que as abelhas sejam mantidas sem a necessidade de controles químicos, visando desenvolver estratégias de seleção que complementam os mecanismos naturais. Será exposta uma história das pesquisas do laboratório, demonstrando a relevância para este tema.

7) Mecanismos de sinalização molecular em resposta a danos no DNA- Profa. Dra. Elza Tiemi Sakamoto Hojo
Ementa: Serão abordados os mecanismos de mutagênese e reparo do DNA em resposta a danos no DNA induzidos por agentes químicos e físicos, relacionando-os com a indução de instabilidade genômica. Além disso, associar a indução de lesões no DNA e dano oxidativo ao desenvolvimento de senescência e instabilidade genômica relacionadas à etiologia de doenças humanas (câncer, diabetes, doença de Alzheimer, entre outras), bem como as bases moleculares para novas intervenções terapêuticas (alvos moleculares) e formas de prevenção das doenças. Tais abordagens fornecem os fundamentos para a compreensão do processo de envelhecimento, desenvolvimento do câncer, doenças neurodegenerativas e cardiovasculares.

8) Uso do sistema Crispr-Cas9 para mutagenizar o gene autoimmune regulator (Aire)- Prof. Dr. Geraldo Aleixo Passos
Ementa: O gene Aire é um controlador transcricional de amplo espectro e exerce sua ação nas células estromais do timo (órgão linfoide primário). Pacientes com a síndrome autoimune "APS-1" tem mutações nesse gene e apresentam perda da tolerância imunológica e desenvolvem doença autoimune.Nós estamos utilizando o sistema Crispr-Cas9 para induzir mutações no gene Aire em células tímicas e avaliando os efeitos no transcriptoma dessas células e também na funcionalidade das mesmas.

9) Estudo de genes associados a tolerância a estresses físico-químicos extremos - Prof. Dr. Tiago Campos Pereira
Ementa: Algumas espécies de bactérias, plantas e animais são capazes de entrar em um estado de animação suspensa denominado anidrobiose (vida sem água). Uma vez em anidrobiose estes organismos apresentam tolerância a diversos tipos de estresses bio-físico-químicos. O laboratório de Genética Molecular da Anidrobiose trabalha no estudo da compreensão deste fenômeno e nos genes a ele associados.

10) O teste de uma hipótese científica - Prof. Dr. Aguinaldo Luiz Simões.
Ementa: A palestra busca fazer algumas considerações sobre o que é uma hipótese científica e como o teorema de Bayes se aplica a vários modelos de hipóteses científicas.

11) Dinâmica populacional e uso forense de polimorfismos genéticos associados a fenótipos morfológicos no Brasil - Prof. Dr. Celso Teixeira Mendes Junior
Ementa: A pigmentação humana é regulada por mais de 120 genes. Tais genes podem apresentar mutações e polimorfismos localizados em regiões codificantes, regulatórias e de splicing, as quais podem determinar substituições de aminoácidos na proteína, alterar níveis de expressão e produzir diferentes isoformas proteicas, alterando as propriedades funcionais das proteínas traduzidas e, consequentemente, os níveis de síntese de eumelanina e feomelanina. O conhecimento da variabilidade genética destes genes na população brasileira, a qual é formada pela fusão de contingentes populacionais indígena, africano e europeu, poderá permitir com que a análise de material biológico encontrado em cenas de crime forneça informações relevantes sobre as características morfológicas de vítimas e criminosos envolvidos. Em situações caracterizadas pela ausência de suspeitos, tais informações poderiam contribuir significantemente no direcionamento de investigações conduzidas em uma esfera liderada pelos serviços de inteligência policial. Serão abordados avanços recentes no que se refere à predição da pigmentação humana e os esforços do grupo do Laboratório de Pesquisas Forenses e Genômicas na busca por um conjunto de SNPs que conduzam a uma determinação precisa e acurada da cor da pele e cabelos em indivíduos de populações tão heterogêneas e miscigenadas quanto a nossa população urbana.

12) Genética de fungos patogênicos – Prof. Dr. Antonio Rossi Filho
Ementa: Fungos patogênicos apresentam grandes problemas para a saúde humana devido às dificuldades de controla e combater os mesmo por meio de fármacos. Sendo eucariotos, os fungos são muito mais próximos à nossa espécie do que as bactérias e vírus. Como eucariotos compartilham conosco as mesmas vias regulatórias genômicas. Desta forma o profundo conhecimento da genética dos fungos é fundamental para o desenvolvimento de estratégias de controle.

13) Doenças metabólicas hereditárias – Profa. Dra. Aparecida Maria Fonye
Ementa: Doenças metabólicas hereditárias, como mucopolissacaridose e outras têm consequências graves para os pacientes, muitas desde a infância. O conhecimento da base genética destas doenças é de fundamental importância para o desenvolvimento de procedimentos de tratamento.

14) Genética do câncer pediátrico de meduloblastoma – Prof. Dr. Carlos Alberto Scrideli
Ementa: O meduloblastoma é o tumor cerebral maligno mais comum em crianças. Eles representam 20% dos tumores infantis do sistema nervoso central e é diagnosticado com maior frequência entre 5 e 9 anos de idade. No entanto, o meduloblastoma pode ser observado em adolescentes mais velhos e, menos comumente, em adultos. O meduloblastoma pode ser dividido em quatro subgrupos com base nas características moleculares das células tumorais. O nosso grupo busca identificar marcadores moleculares destes subgrupos para estabelecer possíveis estratégia de diagóstico e prognóstico.

15) Processo epigenéticos no desenvolvimento embrionário de mamíferos – Profa. Dra. Ester Silveira Ramos
Ementa: No desenvolvimento embrionário de mamíferos ocorrem duas ondas de de- e remetilação do DNA que geram marcas importantes. Muitas destas marcas podem apresentar específicas para alenos paternos vs. maternos de um mesmo gene, por exemplo, em genes da sinalização da via insulínica. Desta forma, marcas epigenéticaspodem ter grade influência sobre o progresso ordenado do desenvolvimento embrionário fetal.

16) PTEN – um regulador chave da via de sinalização insulínica tem um papel crucial no desenvolvimento de câncer – Prof. Dr. Jeremy Andrew Squire
Ementa: O produto do gene PTEN é um importante regulador negativo da atividade da via de sinalização insulínica e, consequentemente, o gene PTEN é classificado como gene supressor de câncer que, em aspectos essenciais, é a desregulação de processos de crescimento e proliferação celular. A via de sinalização insulínica, junto com a via TOR, é uma das vias filogeneticamente mais antigas que permite a uma célula aferir a disponibilidade de nutrientes e, de acordo, coordenar o processo proliferativo. Por meio de métodos de citogenética molecular buscamos compreender o papel de mutações em PTEN no desenvolvimento de diversos tipos de câncer, como câncer de próstata, glioblastoma e outros.

17) Genotóxicidade e antigenotóxicidade de antioxidantes da dieta – Profa. Dra. Lusânia M. Greggi Antunes
Ementa: Por meio da nossa dieta estamos diariamente expostos a compostos com potencial de genotoxicidade. O nosso laboratório busca entender como compostos antioxidantes na dieta possam contribuir a diminuir risco de genotoxicidade em alimentos, especialmente em alimentos processados.

18) Genética da formação da flores em plantas – Profa. Dra. Maria Helena de Souza Goldman
Ementa: A flor é o órgão reprodutivo da planta e assim, a formação da flor define uma fase importante no ciclo de vida das plantas. Em nossos estudos sobre o modelo da planta de tabaco, Nicotiana tabaccum, conseguimos identificar um gene que é critico para a formação do estilo, especificamente o tamanho do estilo. O objetivo é compreender como este gene, um regulador da proliferação celular define o formato do estilo, que é um órgão fundamental da parte feminina da flor e que recebe o pólen.

19) Farmacogenética – Prof. Dr. Riccardo Lacchini
Ementa: A Farmacogenética é a área da genética que estuda como cada pessoa, de forma individual, reage aos fármacos, sejam eles um anestésico, um remédio para dor de cabeça, um quimioterápico ou um antidepressivo. Neste sentido, ao buscar a base genética para tais diferenças individuais, a farmacogenética é uma áre achafe da medicina personalizada.

20) Genética de câncer hematológico – Prof. Dr. Rodrigo A. Panepucci
Ementa: Em anos recentes houve grandes progressos na produção e caracterização de células tronco mesenquimais e de células tronco hematopoiético a partir de variadas culturas primárias. O nosso laboratório estuda a base molecular da diferenciação destas células em busca de evidências da função in vivo de células do sistema hematopoético, tanto em condição normal como em câncer.

21) Modelagem de docking como fermenta de análise de bioinformática de proteínas– Profa. Dra. Silvana Giuliatti
Ementa: Um dos grandes avanços da bioinformática foi a criação de programas e ferramentas que permitem modelar a interação entre macromoléculas, especialmente proteínas e compostos menores, por exemplo fármacos. O molecular docking permite a modelagem destas interações e, desta forma, reconstruir, por exemplo processos evolutivos, ou aprimorar o desenho de fármacos sem a necessidade de realizar custosos experimentos químicos e/ou bioquímicos.

22) Melhoramento genético por meio de transgênese – Cana de açúcar – Dra. Silvana ão fundamental A. Creste Dias de Souza
Ementa: Cana de açúcar é uma das grandes commodities da produção agrícola brasileira. Assim, a produtividade por hectare é uma questão fundamental para o produtor. No Centro da Cana do Instituto Agronômico (IAC) realizamos estudos por meio de transgênese para gerar linhagens de cana de açúcar de alta produtividade e resist6encia à patógenos.

23) Genômica de câncer - Prof. Dr. Wilson Araújo da Silva Júnior
Ementa: Uma das promessas do sequenciamento do genoma humano era de compreender o desenvolvimento de câncer por desregulação de processos de diferenciação e proliferação celular. A promessa continua em aberta, mas houve grandes avanços por meio de abordagens de genômica comparativa e de transcriptômica. Entre os genes que chamaram atenção especial, são os genes Hox, que regulam processos fundamentais do desenvolvimento embrionário do nosso corpo. A compreensão das funções regulatórios destes genes é uma das áreas atualmente na frente do conhecimento da biologia do câncer.

24) Experiências na realização de projetos de pesquisa de Mestrado - Alunos do Programa de Pós-Graduação Genética em Genética
Ementa: O objetivo destas apresentações é familiarizar os alunos participantes do nosso Curso de Versão sobre o que se espera de um Projeto de Mestrado na área de Genética

25) Experiências na realização de projetos de pesquisa de Doutorado - Alunos do Programa de Pós-Graduação Genética em Genética
Ementa: O objetivo destas apresentações é familiarizar os alunos participantes do nosso Curso de Versão sobre o que se espera de um Projeto de Doutorado na área de Genética.

26) Experiências na realização de projetos de pesquisa de Doutorado Direto - Alunos do Programa de Pós-Graduação Genética em Genética
Ementa: O objetivo destas apresentações é familiarizar os alunos participantes do nosso Curso de Versão sobre o que se espera de um Projeto de Doutorado Direto na área de Genética.

27) Experiências de internacionalização em projetos de pesquisa de Doutorado I - Alunos do Programa de Pós-Graduação Genética em Genética
Ementa: A internacionalização, i.e., o contato com grupos internacionais de pesquisa por meio de estadias prolongadas em laboratórios no exterior é uma experiencia interessante e cada vez mais importante na formação de pesquisadores. Procuramos, por meio de relatos de experiências de alunos, apresentar informações aos participantes do Curso de Verão.

28) Experiências de internacionalização em projetos de pesquisa de Doutorado II - Alunos do Programa de Pós-Graduação Genética em Genética
Ementa: A internacionalização, i.e., o contato com grupos internacionais de pesquisa por meio de estadias prolongadas em laboratórios no exterior é uma experiencia interessante e cada vez mais importante na formação de pesquisadores. Procuramos, por meio de relatos de experiências de alunos, apresentar informações aos participantes do Curso de Verão.

29) O Programa de Genética de Pós-Graduação em Genética da FMRP-USP – Prof. Dr. Klaus Hartmann Hartfelder
Ementa: Após as apresentações das principais linhas de pesquisa do nosso Programa de Pós-Graduação em Genética e dos relatos dos alunos do nosso Programa sobre projetos e experiências de internacionalização, o objetivo desta apresentação é de informar os participantes do Curso de Verão sobre a história do nosso Programa, como o mesmo se tornou um dos melhores programas em Genética, e sobre novas tendências.

MINICURSOS:

1) Introdução a práticas moleculares laboratoriais com enfoque em PCR quantitativa em tempo real - Profa. Dra. Zilá Luz Paulino Simões
Ementa: Uma das práticas moleculares mais utilizadas em diversas áreas e tipos de pesquisas é a PCR quantitativa. Essa técnica permite uma gama de aplicações e utilizações no cotidiano de práticas laboratoriais, sendo uma das técnicas mais difundidas da biologia molecular. No minicurso, será mostrado alguns protocolos de extração de RNA, sínese de cDNA, PCR tradicional e qPCR e como os resultados obtidos podem ser interpretados.

2) Cultura celular de tumores pediátricos - Prof. Dr. Carlos Alberto Scrideli
Ementa: Mediante conceitos teóricos e atividades práticas, demonstraremos um conjunto de técnicas que permitem cultivar ou manter células isoladas fora do organismo onde existem, mantendo as características próprias.

3) Uso do sistema CRISP-Cas9 para mutagenizar o gene autoimmune regulator (Aire) - Prof. Dr. Geraldo A. S. Passos Jr
Ementa: O gene Aire é um controlador transcricional de amplo espectro e exerce sua ação nas células estromais do timo (órgão linfoide primário). Pacientes com a síndrome autoimune "APS-1" tem mutações nesse gene e apresentam perda da tolerância imunológica e desenvolvem doença autoimune.Nós estamos utilizando o sistema Crispr-Cas9 para induzir mutações no gene Aire em células tímicas e avaliando os efeitos no transcriptoma dessas células e também na funcionalidade das mesmas. veremos como utilizar a ferramenta de Crispr-Cas9 para induzir mutações no exon 3 de Aire, como caracterizar essas mutações e como avaliar a expressão gênica transcricional em grande escala, comparando clones Aire mutantes com clones Aire wild-type.

4) Análise do ciclo celular e morte celular por citometria de fluxo - Profa. Dra. Elza T. S. Hojo
Ementa: Os agentes químicos e físicos induzem variados tipos de lesões na molécula de DNA e ativam cascatas de sinalização celular e molecular em resposta a essas lesões. Entre os processos envolvidos, destacam-se as alterações na cinética do ciclo celular e bloqueio em estágios do ciclo celular (G1, S ou G2), a indução de quebras duplas no DNA (por detecção da proteína gama-H2AX fosforilada) bem como a indução de morte celular (apoptose e necrose). Tais alterações podem ser avaliadas por meio de ensaios realizados por citometria de fluxo. Os métodos envolvem o uso de corantes e anticorpos fluorescentes, podendo ser aplicados em estudos de genotoxicidade e mutagenicidade de compostos químicos, agentes físicos e outras situações que envolvem exposição humana (terapias ou acidentes) ou doenças..

5) Estudando função gênica em plantas com a biologia molecular: Profa. Dra. Maria H. S Goldman
Ementa: Breve histórico da biologia molecular de plantas, como por exemplo, as plantas modelos, os primeiros experimentos, etc. Também será feita uma revisão das ferramentas utilizadas em biologia molecular de plantas, desde as primeiras até as mais recentes. Debateremos ainda a situação dos transgênicos no Brasil e no mundo, no âmbito jurídico, com enfoque na lei de biossegurança, finalizando com uma perspectiva dessa área de pesquisa para os próximos anos.

6) Investigação genética em síndromes de câncer hereditário - Prof. Dr. Victor E. de Faria Ferraz
Ementa: Serão abordados aspectos genéticos e clínicos de síndromes hereditárias de predisposição a câncer, bem como metodologias atuais de diagnóstico molecular dessas síndromes, com ênfase nas síndromes de Lynch e HBOC. Por meio de softwares de análise de sequências gênicas e de fragmentos por eletroforese, os alunos terão práticas de detecção e interpretação de variantes genômicas em genes associados à câncer hereditário.

7) Técnicas moleculares aplicadas ao estudo de genes em fungos patogênicos: Profa. Dra. Nilce M. M. Rossi
Ementa: Os dermatófitos como Trichophyton rubrum são fungos filamentosos patogênicos que, uma vez estabelecidos em seu hospedeiro, buscam nutrientes para o seu desenvolvimento. A secreção de enzimas, como queratinases, é um fator determinante na invasão e utilização dos tecidos do hospedeiro como fonte de nutrientes e é frequentemente regulada pelo pH. Assim, a utilização da genômica funcional no estudo da expressão gênica é uma ferramenta poderosa na revelação de genes envolvidos na patogenicidade deste dermatófito.

8) Molecular docking – como funciona? Profa. Dra. Silvana Giuliatti
Ementa: Mostraremos neste minicurso alguns dos principais programa e algoritmos que se utiliza realizar análises de molecular docking.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Menck CFM, van Sluys M-A (2017) Genética Molecular. Guanabara Koogan
Snustad DP, Simmons MJ (2017) Fundamentos da Genética. 5ª edição. Guanabara Koogan.
Pierce BA (2016) Genética – Um Enfoque Conceitual. 5ª edição. Guanabara Koogan
Jorde LB, Carey JC, Bamshad MJ (2017) Genética Médica. 5ª edição. Guanabara Koogan
Turnpenny PD, Ellard S (2016) Emery’s Elements of medical Genetics. 15a edição. Elsevier
Lesk AM (2019) Introduction to Bioinformatics. Oxford University Press.
Lesk AM (2017) Introduction to Genomics. Oxford University Press.
Baxevanis AD, Bader GD, Wishart DS (2020) Bionformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. 4a edição, Wiley.

Carga Horária:

56 horas
Tipo: Obrigatória
Vagas oferecidas: 50
 
Ministrantes: Aguinaldo Luiz Simões
Antonio Rossi Filho
Aparecida Maria Fontes
Carlos Alberto Scrideli
Celso Teixeira Mendes Junior
David de Jong
Elza Tiemi Sakamoto Hojo
Ester Silveira Ramos
Francis de Morais Franco Nunes
Geraldo Aleixo da Silva Passos Junior
Jeremy Andrew Squire
Klaus Hartmann Hartfelder
Lusania Maria Greggi Antunes
Maria Helena de Souza Goldman
Maura Helena Manfrin
Nilce Maria Martinez Rossi
Riccardo Lacchini
Rodrigo Alexandre Panepucci
Silvana Aparecida Creste Dias de Souza
Silvana Giuliatti
Tiago Campos Pereira
Victor Evangelista de Faria Ferraz
Wilson Araújo da Silva Junior
Zila Luz Paulino Simoes


 
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