Atividade

100243 - Análise de Redes em Epidemiologia Veterinária

Período da turma: 02/08/2021 a 31/12/2023

Selecione um horário para exibir no calendário:
 
 
Descrição: Justificativa:
Em anos recentes, a análise de redes complexas (e teoria dos grafos) passou a ser utilizada
nas áreas biológicas, agrárias e de saúde com crescente intensidade. Esta ferramenta tem
grande aplicação na análise de sistemas de relacionamentos entre entidades, seja uma rede de
computadores conectados, um grupo de pessoas com interações sociais, difusão de
informação entre animais, comércio de animais entre propriedades, comércio de animais entre
países, etc. Especificamente, a ferramenta tem grande aplicação em epidemiologia, por permitir
entender a estrutura de contatos entre indivíduos ou grupos de indivíduos, pelos quais uma
doença é transmitida.
Objetivo:
Capacitar o aluno a analisar redes complexas, com ênfase em epidemiologia veterinária.
Ementa:
1 – Redes complexas: conceitos e definições. Extração de rede a partir de um banco de dados
de trânsito de animais. 2 – Cálculo (ou estimativa) de parâmetros de rede. 3 – Modelos de
redes complexas (regulares, Poisson, pequeno mundo, livres de escala) e geração de redes
aleatórias. 4 – Modelos epidêmicos em redes complexas: dinâmica e controle (SI, SIS, SIR,
etc.). 5 – Identificação de comunidades. 6 – Lei de Pareto, Assortatividade e Paradoxo da
Amizade. 7 – Aplicações de análise de redes em Epidemiologia.
Plano de atividades:
Introdução ao software R
Introdução ao software Gephi
Manusear bancos de dados de registros de movimentações animais (rede de trânsito animal)
Conversão de bancos de dados de trânsito animal em matrizes esparsas de redes complexas
Cálculos de parâmetros descritivos de nós dentro de uma rede de trânsito animal: Graus de
entrada, de saída, total, ponderado por animais, ponderado por movimentações, PageRank,
Cadeia de conexões de entrada, Cadeia de conexões de saída
Cálculos de parâmetros descritivos de uma rede de trânsito animal: Distribuição de graus
(ajuste à uma Lei de Potência), Aplicação da Lei de Pareto, Detecção do Paradoxo da
Amizade. Desenvolvimento de produto próprio (análise descritiva de uma rede de trânsito
animal)
Bibliografia:
Dubé, C., Ribble, C., Kelton, D., & McNab, B. (2009). A review of network analysis terminology
and its application to foot­and­mouth disease modelling and policy development. Transboundary
and Emerging Diseases, 56(3), 73–85. http://doi.org/10.1111/j.1865­1682.2008.01064.x
Feld, S. L. (1991). Why Your Friends Have More Friends than You Do. American Journal of
Sociology, 96(6), 1464–1477.
Fortunato, S. (2010). Community detection in graphs. Physics Reports, 486(3­5), 75–74.
Retrieved from http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0370157309002841
Frössling, J., Ohlson, A., Björkman, C., Håkansson, N., & Nöremark, M. (2012). Application of
network analysis parameters in risk­based surveillance ­ Examples based on cattle trade data
and bovine infections in Sweden. Preventive Veterinary Medicine, 105(3), 202–8.
http://doi.org/10.1016/j.prevetmed.2011.12.011
Langville, A. N., & Meyer, C. D. (2006). Google’s PageRank and Beyond: The Science of
Search Engine Rankings. Princeton University Press.
Martínez­López, B., Perez, A. M., & Sánchez­Vizcaíno, J. M. (2009). Social network analysis.
Review of general concepts and use in preventive veterinary medicine. Transboundary and
Emerging Diseases, 56(4), 109–20. http://doi.org/10.1111/j.1865­1682.2009.01073.x
Newman, M. E. J. (2003). The Structure and Function of Complex Networks. SIAM Review,
45(2), 167–256. Retrieved from http://epubs.siam.org/doi/abs/10.1137/S003614450342480
Nöremark, M., & Widgren, S. (2014). EpiContactTrace: an R­package for contact tracing during
livestock disease outbreaks and for risk­based surveillance. BMC Veterinary Research, 10, 71.
http://doi.org/10.1186/1746­6148­10­71
Page, L., Brin, S., Motwani, R., & Winograd, T. (1999). The PageRank Citation Ranking:
Bringing Order to the Web. Stanford InfoLab. Retrieved from
http://infolab.stanford.edu/~backrub/pageranksub.ps

Carga Horária:

54 horas
Tipo: Obrigatória
Vagas oferecidas: 20
 
Ministrantes: José Henrique de Hildebrand e Grisi Filho
Marcos Amaku


 
 voltar

Créditos
© 1999 - 2024 - Superintendência de Tecnologia da Informação/USP