100243 - Análise de Redes em Epidemiologia Veterinária |
Período da turma: | 02/08/2021 a 31/12/2023
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Descrição: | Justificativa:
Em anos recentes, a análise de redes complexas (e teoria dos grafos) passou a ser utilizada nas áreas biológicas, agrárias e de saúde com crescente intensidade. Esta ferramenta tem grande aplicação na análise de sistemas de relacionamentos entre entidades, seja uma rede de computadores conectados, um grupo de pessoas com interações sociais, difusão de informação entre animais, comércio de animais entre propriedades, comércio de animais entre países, etc. Especificamente, a ferramenta tem grande aplicação em epidemiologia, por permitir entender a estrutura de contatos entre indivíduos ou grupos de indivíduos, pelos quais uma doença é transmitida. Objetivo: Capacitar o aluno a analisar redes complexas, com ênfase em epidemiologia veterinária. Ementa: 1 – Redes complexas: conceitos e definições. Extração de rede a partir de um banco de dados de trânsito de animais. 2 – Cálculo (ou estimativa) de parâmetros de rede. 3 – Modelos de redes complexas (regulares, Poisson, pequeno mundo, livres de escala) e geração de redes aleatórias. 4 – Modelos epidêmicos em redes complexas: dinâmica e controle (SI, SIS, SIR, etc.). 5 – Identificação de comunidades. 6 – Lei de Pareto, Assortatividade e Paradoxo da Amizade. 7 – Aplicações de análise de redes em Epidemiologia. Plano de atividades: Introdução ao software R Introdução ao software Gephi Manusear bancos de dados de registros de movimentações animais (rede de trânsito animal) Conversão de bancos de dados de trânsito animal em matrizes esparsas de redes complexas Cálculos de parâmetros descritivos de nós dentro de uma rede de trânsito animal: Graus de entrada, de saída, total, ponderado por animais, ponderado por movimentações, PageRank, Cadeia de conexões de entrada, Cadeia de conexões de saída Cálculos de parâmetros descritivos de uma rede de trânsito animal: Distribuição de graus (ajuste à uma Lei de Potência), Aplicação da Lei de Pareto, Detecção do Paradoxo da Amizade. Desenvolvimento de produto próprio (análise descritiva de uma rede de trânsito animal) Bibliografia: Dubé, C., Ribble, C., Kelton, D., & McNab, B. (2009). A review of network analysis terminology and its application to footandmouth disease modelling and policy development. Transboundary and Emerging Diseases, 56(3), 73–85. http://doi.org/10.1111/j.18651682.2008.01064.x Feld, S. L. (1991). Why Your Friends Have More Friends than You Do. American Journal of Sociology, 96(6), 1464–1477. Fortunato, S. (2010). Community detection in graphs. Physics Reports, 486(35), 75–74. Retrieved from http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0370157309002841 Frössling, J., Ohlson, A., Björkman, C., Håkansson, N., & Nöremark, M. (2012). Application of network analysis parameters in riskbased surveillance Examples based on cattle trade data and bovine infections in Sweden. Preventive Veterinary Medicine, 105(3), 202–8. http://doi.org/10.1016/j.prevetmed.2011.12.011 Langville, A. N., & Meyer, C. D. (2006). Google’s PageRank and Beyond: The Science of Search Engine Rankings. Princeton University Press. MartínezLópez, B., Perez, A. M., & SánchezVizcaíno, J. M. (2009). Social network analysis. Review of general concepts and use in preventive veterinary medicine. Transboundary and Emerging Diseases, 56(4), 109–20. http://doi.org/10.1111/j.18651682.2009.01073.x Newman, M. E. J. (2003). The Structure and Function of Complex Networks. SIAM Review, 45(2), 167–256. Retrieved from http://epubs.siam.org/doi/abs/10.1137/S003614450342480 Nöremark, M., & Widgren, S. (2014). EpiContactTrace: an Rpackage for contact tracing during livestock disease outbreaks and for riskbased surveillance. BMC Veterinary Research, 10, 71. http://doi.org/10.1186/174661481071 Page, L., Brin, S., Motwani, R., & Winograd, T. (1999). The PageRank Citation Ranking: Bringing Order to the Web. Stanford InfoLab. Retrieved from http://infolab.stanford.edu/~backrub/pageranksub.ps |
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Carga Horária: |
54 horas |
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Tipo: | Obrigatória | ||||
Vagas oferecidas: | 20 | ||||
Ministrantes: |
José Henrique de Hildebrand e Grisi Filho Marcos Amaku |
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